2018年上海植物逆境中心以第一单位发表45篇论文影响因子达427分!

时间:2019-03-01 阅读:

中国科学院上海植物逆境生物学研究中心(以下简称研究中心)由美国科学院院士朱健康教授领衔,在中国科学院、上海市和国家有关部委联合支持下,依托中国科学院上海生命科学研究院研究平台,与上海市共建中国科学院直属的国立研究机构。2012年4月28日,中组部、国家有关部委、中国科学院以及上海市联合在逆境中心选址地点举行揭牌仪式。

建立研究中心是中国政府在发展植物科学与生物技术等相关领域的重大战略部署之一。研究中心采用与国际接轨的管理和运行机制,实行"人才特区"政策,在用人、财务、管理及考核方面实行灵活政策,为科学家创造一流的创新环境。研究中心聚焦植物科学前沿领域与生物技术重大战略性科学问题,凝聚一流的研究团队,以知识创新为基础、以解决国家重大战略科技问题为目标,成为植物科学前沿领域与生物技术原始创新的源头、高水平创新人才培养的基地、新型科研体制机制探索的试验田。经过5-10年的不懈努力,建成植物科学前沿与生物技术领域国际一流的科学研究、学术交流、人才培养与产业促进中心。

1.2018年5月21日,Nature Reviews Molecular Cell Biology在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究员、张惠明研究员与郎曌博研究员共同完成的题为"Dynamics and function of DNA methylation in plants"的综述文章。 在本综述中,朱健康等人讨论了植物中的DNA甲基化,包括甲基化和去甲基化酶和调控因子,以及通过所谓的甲基化状态机制协调甲基化和去甲基化活性;DNA甲基化在调控转座子沉默,基因表达和染色体相互作用中的功能;DNA甲基化在植物发育中的作用;以及DNA甲基化参与植物对生物和非生物胁迫条件的反应。(点击查看重磅朱健康团队在国际综述杂志发表文章,阐述DNA甲基化过程)

2.2018年8月6日,Nature Genetics杂志背靠背在线发表了两篇来自中国科学院分子植物卓越中心植物逆境生物学研究中心研究性研究论文!!它们分别是:杜嘉木课题组与美国威斯康辛大学钟雪花课题组合作完成题为"EBS is a bivalent histone reader that regulates floral phase transition in Arabidopsis"的研究论文;和何跃辉课题组题为"Polycomb-mediated gene silencing by the BAH-EMF1 complex in plants"研究论文。杜嘉木课题组的研究综合利用结构生物学、生物化学、细胞生物学以及植物分子遗传学等多种研究手段相结合的方式,全面揭示了二价组蛋白阅读器EBS在拟南芥花期调控中的作用机制。而何跃辉课题组的研究论文报道了植物特有的染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的SHL和EBS分别形成BAH-EMF1复合体,介导高等植物基因沉默的分子机制。(点击查看重磅!中科院植物逆境中心同时发表两篇Nature Genetics文章!)

基于定量磷酸化蛋白组学分析,逆境中心的研究人员发现ABA 受体PYR1/PYLs 蛋白存在一个保守的磷酸化位点,ABA 抑制这一位点的磷酸化。外源ABA 处理后,PYL蛋白中这一位点的磷酸化消失。通过点突变模拟这一位点的磷酸化发现磷酸化的PYL蛋白不能结合ABA,也不能抑制PP2C 的活性,失去感受和传递ABA 信号的功能。非磷酸化形式的的PYL转基因植物的恢复生长(Recovery Growth)与野生型相比明显延迟。研究人员进一步发现TOR 能特异地磷酸化PYL 蛋白这一位点。已知TOR 蛋白高等生物中非常保守的,控制细胞能量代谢、细胞生长和发育过程的关键因子。tor 突变体以及TOR 复合体组分突变体raptor 等对ABA 敏感,并在正常条件下表现出生长抑制、SnRK2 活性增加、胁迫应答基因表达等胁迫类似表型。同时,TOR 复合体中的调节组分RaptorB 是ABA受体下游核心蛋白激酶SnRK2 的底物。胁迫条件下ABA激活SnRK2 蛋白激酶,并通过磷酸化RaptorB 蛋白,促进TOR复合体的解离,抑制TOR的活性。这一研究发现ABA 受体的磷酸化调控机制,并发现TOR 蛋白激酶复合体和ABA 受体偶联途径组成的调节环(loop)平衡植物生长发育和胁迫应答的分子机理。

5.2018年7月3日,Nature Communications杂志在线发表了来自中科院上海植物逆境生物学研究中心杨贞标课题组题(现在任职单位在福建农林大学园艺植物生物学和代谢组学研究中心)为"The REN4 rheostat dynamically coordinates the apical and lateral domains of Arabidopsis pollen tubes"研究论文。该论文鉴定了WD40结构域蛋白REN4,该蛋白动态定位于生长花粉尖管的端和侧面的之间的collar区域,并在顶端和侧面结构域之间的精确时空协调中,通过与ROP1相互作用而起到时空变阻器的作用,在花粉管生长期间调节极性和生长速率。因此,该研究揭示了在时空动态中极性区域的前后之间如何协调的新机制。点击查看【Nature 子刊】中科院上海植物逆境中心杨贞标课题组揭示了调控细胞极性的新机制

6.2018年5月17日,Nature Communications在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为"CRISPR/Cas9-mediated gene targeting in Arabidopsis using sequential transformation"的研究论文。该研究报道了一种在拟南芥中基于二次转化策略与CRISPR/Cas9系统的超长基因片段高效精准敲入/替换技术。它可以在拟南芥基因组精准定向地实现单氨基酸或段的插入或替换,且编辑位点无需任何标记辅助筛选,效率高达5-10%。此研究大大推进了CRISPR系统在植物中的应用,为植物基因定点编辑提供了一个新方法。点击查看【一作解读】朱健康课题组在植物中实现超长基因片段高效精准无赘敲入/替换编辑!

7.2018年12月4日,中科院上海逆境中心郎曌博与中科院植物生理生态研究所张一婧共同通讯在Genome Biology在线发表题为"Downregulation of RdDM during strawberry fruit ripening"的研究论文,该论文在八倍体栽培草莓(Fragaria x ananassa)的果实成熟的不同阶段表征了DNA甲基化组,全基因组siRNA谱和转录组。与未成熟果实相比,观察到成熟果实中的整体DNA去甲基化,类似于在番茄成熟期间观察到的。 总之,该研究首次揭示了non-climacteric果实成熟过程中DNA甲基化的动态,并提出了果实成熟过程中DNA甲基化丧失的独特机制。点击查看Genome Biology 重大进展,郎曌博/张一婧首次揭示草莓成熟过程DNA甲基化变化机制

10.2018年5月21日,PNAS杂志在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组发表题为"Mutations in a subfamily of abscisic acid receptor genes promote rice growth and productivity"的研究论文,该研究通过同时突变ABA受体基因PYL1、PYL4和PYL6后,水稻的生物量明显增加,谷产量增加了31%。该研究揭示了这些ABA受体在调控水稻生长发育过程中的重要作用,更为重要的是为提高水稻产量提供了新的遗传策略。点击查看PNAS 朱健康课题组最新研究使水稻产量提高了31%!

在该研究中,研究人员使用了更为精准的酶活测定系统,质谱结果表明JMJ14是一个H3K4me3和me2的去甲基化酶,而对me1作用不明显。而后利用X射线晶体衍射的方法解析了JMJ14处于apo状态和底物复合物状态的结构。JMJ14主要有jumonji、helical以及C5HC2三个结构域组成,其中jumonji以及C5HC2结构域上的3个酸性氨基酸与组蛋白小肽上H3R2和H3Q5发生了大量的氢键以及盐键的相互作用,形成特异性识别。将这几个酸性氨基酸突变之后,JMJ14的体内酶活显著下降,表明这几个氨基酸确实参与了底物识别。此外,由于人源KDM5家族蛋白是一个重要的抗癌药物靶标,而其底物识别机制还不是很清楚。通过氨基酸序列和三维结构比对发现,JMJ14参与底物识别的氨基酸在KDM5B中也非常保守,暗示这它们采用了相似的底物识别机制。之后将KDM5B中相应的氨基酸突变后其酶活明显下降,证明了以上猜想。该项工作不仅解析了以JMJ14为代表的KDM5亚家族H3K4me3去甲基化酶的去甲基化机制,还为以人源KDM5为靶标的抗癌药物开发提供了理论基础。

本研究中,研究人员发现在植物病毒与宿主细胞的博弈之战中,调控植物生长发育的受体蛋白BAM1可以促进细胞之间RNAi的扩散。BAM1蛋白在细胞中定位于细胞膜和胞间连丝中。胞间连丝是临近细胞间连接的通道,并且可能有助于小RNA携带的信息传播。然而,作为演化过程中宿主和病原菌共同进化的结果,如果一个宿主蛋白在免疫反应中作用突出,致病病原菌也必须不断进化来对抗宿主蛋白的效力。该研究组还发现了名为C4的病毒蛋白可以与BAM1结合,并且C4可以干扰RNAi细胞间的传播。该研究结果为更为深入研究RNAi 细胞之间的传播机制奠定了基础,并且为通过生物工程提高农作物抗病性提供了新的思路。

关键词: 上海论文发表服务

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